De 95 kWh-batterij van de e-tron Sportback 55 quattro werkt op 396 volt en kan aan beide zijden van de auto tot 150 kW worden opgeladen. Audi claimt een oplaadtijd van 30 minuten tot 80% van de accucapaciteit en 50 minuten tot 100%. Een van de opties die Audi biedt, is een thuislaadmogelijkheid van 400 volt met 11 kW.
Voortbouwend op de ervaring die is opgedaan met de e-tron 55 quattro, heeft Audi het koelsysteem voor de accu herwerkt. In plaats van twee waterpompen te gebruiken, gebruikt de e-tron Sportback 55 quattro een grote enkele eenheid, waardoor gewicht, kosten en energie worden bespaard in een beweging waarvan wordt beweerd dat deze bijdraagt aan een toename van het bereik met 10 km ten opzichte van de e-tron 55 quattro op 446 km onder de WLTP-testprocedure.